梯度PCR擴增儀是DNA擴增的一種儀器設備，被廣泛運用于醫學、生物學實驗室中，例如用于判斷檢體中是否會表現某遺傳疾病的圖譜、傳染病的診斷、基因復制以及親子鑒定等。
一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀稱作傳統PCR儀，也叫普通PCR儀。如果要做不同的退火溫度需要多次運行，主要是用于簡單的、對目的基因退火溫度的擴增，該儀器主要應用于科學研究、教學、醫學臨床、檢驗檢疫等機構。
PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件（溫度梯度，通常有12種溫度梯度）的PCR儀稱作梯度PCR儀，其退火溫度是不同的，通過設置一系列的梯度退火溫度進行擴增，從而一次性PCR擴增，就可以篩選出表達量高的退火溫度，進行有效的擴增，用于研究未知DNA退火溫度的擴增，這樣節約成本的同時也節約了時間。
梯度PCR擴增儀主要用于研究未知DNA退火溫度的擴增，這樣既節約時間，也節約成本，在不設置梯度的情況下亦可當做普通的PCR用，多應用于科研、教學機構,檢驗、檢疫等，用于從細胞內靶DNA的定位分析的細胞內基因擴增儀稱作原位PCR儀，是保持細胞或組織的完整性，使PCR反應體系滲透到組織和細胞中，在細胞的靶DNA所在位置上進行基因擴增。
擴增儀不但可以檢測到靶DNA，又能標出靶序列在細胞內的位置，對于在分子和細胞水平上研究疾病的發病機理和臨床過程及病理的轉變有重大的實用價值，主要應用于臨床、科研。熒光定量檢測技術在臨床診斷方面很多，主要集中在各種病原體引起疾病的臨床診斷，如肝炎類疾病、性病、與優生優育相關的疾病以及肺結核等等。
